Đoàn Trường THPT Chuyên Sơn La có 1 chi đoàn cán bộ giáo viên và 33 chi đoàn học sinh, với 1.168 đoàn viên, thanh niên. Nhiệm kỳ 2023-2024, Đoàn trường đã làm tốt công tác giáo dục chính trị tư tưởng, đạo đức lối sống cho đoàn viên, thanh niên. Đoàn viên là giáo viên luôn nỗ lực nâng cao trình độ chuyên môn, nghiệp vụ, tiếp cận và ứng dụng khoa học kỹ thuật vào học tập và giảng dạy. Đoàn viên học sinh say mê trong học tập, nghiên cứu, sẵn sàng xung kích tình nguyện vì cuộc sống cộng đồng. Đồng thời, triển khai hiệu quả các phong trào, “Thanh niên tình nguyện”, “Tuổi trẻ sáng tạo”, “Tuổi trẻ xung kích bảo vệ Tổ quốc”, thi đua dạy tốt, học tốt...

Trong nhiệm kỳ, 100% học sinh khối 12 thi đỗ tốt nghiệp THPT năm 2024, tham gia các trường đại học, cao đẳng và các trường dạy nghề; 77,5% học sinh đạt học lực giỏi; 17 học sinh đoạt học sinh giỏi quốc gia; có 7 dự án dự thi khoa học kỹ thuật cấp tỉnh và đoạt giải; 1 dự án đoạt giải khuyến khích tại “Liên hoan tuổi trẻ sáng tạo khu vực phía Bắc”. Cùng với đó, Đoàn đã duy trì hoạt động “Ngày thứ 7 tình nguyện”; phối hợp tổ chức các chương trình tình nguyện “Đồng hành với thanh niên”, “Tuổi trẻ xung kích, tình nguyện vì cuộc sống cộng đồng” trồng mới 3.200 cây xanh, xây dựng 2 công trình “Ánh sáng bản làng” tại huyện Phù Yên; phối hợp tổ chức nhiều  hoạt động tặng quà cho học sinh vùng khó khăn.

Nhiệm kỳ 2024-2025, Đoàn trường phấn đấu 100% đoàn viên thanh niên được tham các phong trào hoạt động do nhà trường; 100% đoàn viên thanh niên đạt kết quả rèn luyện từ khá trở lên và đạt học lực từ trung bình trở lên; xây dựng ít nhất 25 chương trình sinh hoạt đoàn của các chi đoàn về các hoạt động trải nghiệm, giáo dục giá trị sống, kỹ năng sống; mỗi chi đoàn xây dựng 1 công trình thanh niên theo chủ đề lớp học, phục vụ nhu cầu học tập, sinh hoạt; giới thiệu ít nhất 2 đoàn viên ưu tú được kết nạp vào Đảng Cộng sản Việt Nam...

Đại hội đã bầu 15 đồng chí vào Ban Chấp hành nhiệm kỳ 2024-2025. Nhân dịp này, Ban Chấp hành Tỉnh đoàn đã tặng bằng khen cho 1 tập thể, 1 cá nhân; Ban Chấp hành Đoàn khối các cơ quan và doanh nghiệp tỉnh tặng giấy khen cho 2 tập thể và 5 cá nhân có thành tích xuất sắc trong nhiệm kỳ 2023-2024.