Công đoàn cơ sở cơ quan Sở Giao thông vận tải có 7 tổ công đoàn với 59 đoàn viên. Nhiệm kỳ 2017-2023, Công đoàn đã thực hiện tốt chức năng bảo vệ quyền và lợi ích hợp pháp, chính đáng của đoàn viên, người lao động. Tổ chức tốt các phong trào thi đua do các cấp, các ngành phát động, như: “Lao động giỏi, Lao động sáng tạo”, “Đẩy mạnh cải cách hành chính Nhà nước của Sở Giao thông vận tải Sơn La” giai đoạn 2021- 2025...

Công tác chăm lo đời sống vật chất, tinh thần đối với công chức, viên chức, người lao động được quan tâm thường xuyên, kịp thời với nhiều hoạt động, như: Thăm hỏi, động viên đoàn viên khi ốm đau, lễ tết, việc hiếu, hỉ; hỗ trợ nữ đoàn viên công đoàn vay nguồn để phát triển kinh tế gia đình; tổ chức Tết thiếu nhi 1/6, Tết Trung thu hàng năm cho các cháu thiếu niên, nhi đồng là con của đoàn viên công đoàn với tổng giá trị trên 110 triệu đồng. Vận động đoàn viên tham gia các hoạt động xã hội từ thiện, đã quyên góp, ủng hộ hàng trăm triệu đồng thực hiện các chương trình an sinh xã hội.

Nhiệm kỳ 2023-2028, Công đoàn Sở Giao thông vận tải phấn đấu 100% đoàn viên không vi phạm tệ nạn xã hội và nghiêm túc thực hiện “4 không về ma túy”; cơ quan giữ vững danh hiệu “Cơ quan đạt chuẩn văn hóa” hàng năm; 90% trở lên đoàn viên đạt danh hiệu Lao động tiên tiến, trong đó 15% đạt danh hiệu Chiến sĩ thi đua các cấp; 100% tổ công đoàn hoàn thành tốt nhiệm vụ trở lên; Công đoàn cơ quan Sở GTVT hoàn thành tốt nhiệm vụ trở lên. Giới thiệu cho Đảng bộ bồi dưỡng, kết nạp vào Đảng từ 2 đoàn viên ưu tú trở lên…

Đại hội đã bầu 5 đồng chí vào Ban Chấp hành Công đoàn cơ sở Sở Giao thông vận tải khóa XXII, nhiệm kỳ 2023-2028; bầu 3 đại biểu dự Đại hội Công đoàn Viên chức tỉnh lần thứ VI, nhiệm kỳ 2023-2028.