Nhận thức được tầm quan trọng của hệ thống chính trị cơ sở, những năm qua, Đảng bộ Bộ Chỉ huy quân sự tỉnh đã lãnh đạo, chỉ đạo cấp ủy, chỉ huy các đơn vị trong lực lượng vũ trang trong tỉnh phối hợp với cấp ủy, chính quyền địa phương tập trung xây dựng, củng cố, nâng cao chất lượng hệ thống chính trị cơ sở gắn với xây dựng “thế trận lòng dân” vững chắc, trọng tâm là nâng cao năng lực lãnh đạo, sức chiến đấu của tổ chức đảng và chất lượng đội ngũ cán bộ, đảng viên; củng cố các cơ sở đảng yếu kém, xây dựng tổ chức đảng trong sạch, vững mạnh, gắn với chăm lo đời sống của nhân dân; huy động sức mạnh của toàn dân phát triển kinh tế - xã hội, giữ vững quốc phòng - an ninh.

Từ hoạt động thực tiễn, lực lượng vũ trang ở các đơn vị đã bám sát sự chỉ đạo của Đảng ủy Bộ Chỉ huy quân sự tỉnh, vận dụng sáng tạo các chỉ thị, nghị quyết của Đảng vào thực tiễn và bám sát địa bàn nơi đơn vị đóng quân, nắm bắt tình hình ở cơ sở, phân tích, đáng giá đúng, trúng những những điểm mạnh, yếu; những vấn đề nổi cộm, mới phát sinh ở địa bàn. Tham mưu với cấp ủy, chính quyền và các tổ chức chính trị ở cơ sở xây dựng nghị quyết, chương trình hành động cụ thể, phát huy mặt mạnh, khắc phục yếu kém, tháo gỡ khó khăn và đã thu được nhiều kết quả quan trọng: hệ thống chính trị được củng cố và ngày càng phát triển, chính quyền vững mạnh, kinh tế phát triển, quốc phòng, an ninh được giữ vững... Tuy nhiên, chất lượng xây dựng hệ thống chính trị cơ sở, gắn với xây dựng “thế trận lòng dân” chưa cao, nhất là ở những nơi có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn, vùng đồng bào dân tộc thiểu số, vùng cao, biên giới còn nhiều hạn chế, tỷ lệ hộ nghèo còn cao so với cả nước, một số địa bàn còn tiềm ẩn những yếu tố có thể gây mất ổn định. Hiện nay, toàn tỉnh còn 67 bản, 9 trường học chưa có chi bộ; 4 bản chưa có đảng viên. Việc đổi mới nội dung, phương thức hoạt động của Mặt trận Tổ quốc và các đoàn thể nhân dân ở cơ sở chưa thực sự đáp ứng được yêu cầu; chưa huy động được hết các nguồn lực để đầu tư hạ tầng thiết yếu cho các vùng có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn; công tác giảm nghèo, ổn định định canh, định cư ở một số vùng còn thiếu bền vững.

Để nâng cao chất lượng hệ thống chính trị cơ sở, gắn với xây dựng “thế trận lòng dân” vững chắc, góp phần thực hiện thắng lợi Nghị quyết Đại hội Đảng bộ tỉnh lần thứ XIV nhiệm kỳ 2015-2020 đề ra, trong những năm tới, Đảng bộ Bộ Chỉ huy quân sự tỉnh tăng cường công tác tham mưu với Tỉnh ủy, HĐND, UBND tỉnh tập trung lãnh đạo các cấp ủy, chỉ huy trong toàn lực lượng tăng cường bám, nắm cơ sở, phối hợp chặt chẽ với cấp ủy, chính quyền địa phương tập trung phát triển kinh tế gắn với quốc phòng, góp phần nâng cao đời sống vật chất, tinh thần của nhân dân, nhất là các xã, các huyện vùng sâu, vùng xa, vùng biên giới đặc biệt khó khăn, tạo điều kiện để đồng bào phấn đấu vươn lên thoát nghèo bền vững, giữ vững an ninh, chính trị - trật tự an toàn xã hội; làm thất bại mọi âm mưu kích động, chia rẽ khối đoàn kết các dân tộc của các thế lực thù địch. Xây dựng niềm tin, sự đồng thuận của nhân dân các dân tộc với cấp ủy, chính quyền địa phương, xây dựng “thế trận lòng dân” vững chắc, nhất là “thế trận lòng dân” ở tuyến biên giới, những nơi có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn, vùng đồng bào dân tộc thiểu số, vùng cao, biên giới. Trước hết Đảng ủy tập trung lãnh đạo công tác xây dựng lực lượng vũ trang vững mạnh về chính trị, có khả năng sẵn sàng chiến đấu cao, thực sự là lực lượng nòng cốt trong xây dựng nền quốc phòng toàn dân, thế trận quốc phòng toàn dân gắn với thế trận an ninh nhân dân, xây dựng khu vực phòng thủ, huyện, tỉnh vững chắc, đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ quốc phòng - an ninh trong giai đoạn hiện nay. Làm tốt công tác tạo nguồn, bồi dưỡng đội ngũ cán bộ ở cơ sở, nhất là công tác tuyển, chọn và gọi công dân thực hiện nghĩa vụ quân sự gắn với định hướng lựa chọn nguồn để phát triển đảng cho hạ sỹ quan, chiến sỹ trong thời gian phục vụ tại ngũ và tạo nguồn phát triển đảng cho địa phương. Thực hiện tốt công tác đào tạo cán bộ quân sự xã, phường, thị trấn; phấn đấu đến năm 2020 có 100% cán bộ chỉ huy trưởng quân sự xã, phường, thị trấn có trình độ trung cấp chuyên nghiệp quân sự, và đạt trình độ trung cấp lý luận chính trị trở lên. Chăm lo xây dựng lực lượng dân quân tự vệ, dự bị động viên vững mạnh, làm nòng cốt trong xây dựng và củng cố hệ thống chính trị ở cơ sở, phấn đấu đến năm 2020 nâng tỷ lệ đảng viên trong DQTV đạt trên 22%, dự bị động viên đạt trên 20%, 100% chi bộ quân sự ở cơ quan, xã phường, thị trấn đạt trong sạch vững mạnh. Tập trung lãnh đạo lực lượng vũ trang tỉnh tham gia xây dựng nông thôn mới, xóa đói, giảm nghèo, khắc phục thiên tai; phân công cán bộ phụ trách bám nắm địa bàn cơ sở. Phối hợp triển khai thực hiện tốt Chỉ thị số 84/CT-BQP của Bộ Quốc phòng về thực hiện Chiến lược công tác dân tộc đến năm 2020; triển khai xây dựng đề án “Xây dựng các điểm dân cư tập trung, bố trí việc làm cho đồng bào dân tộc thiểu số ở khu vực biên giới; bảo vệ và phát triển rừng vành đai đến năm 2020”... góp phần ổn định dân cư khu vực biên giới, xây dựng “thế trận lòng dân”, bảo vệ vững chắc chủ quyền biên giới, giữ vững ổn định chính trị - xã hội, tạo điều kiện phát triển kinh tế - xã hội của tỉnh, phấn đấu hoàn thành thắng lợi mục tiêu sớm xây dựng Sơn La trở thành tỉnh phát triển khá trong vùng Trung du và miền núi phía Bắc.