Theo quy định tại Nghị định số 20/2014/NĐ-CP, huyện Bắc Yên có 15/16 xã, thị trấn đạt phổ cập giáo dục THCS mức độ 2; 1/16 xã đạt mức độ 3. Số thanh, thiếu niên từ 15 đến 18 tuổi tốt nghiệp THCS đạt 86%; từ 15 đến 18 tuổi đang học chương trình giáo dục phổ thông hoặc giáo dục thường xuyên cấp THPT hoặc giáo dục nghề nghiệp đạt 59,4%. Toàn huyện có 145 lớp, đạt tỉ lệ 1 phòng/lớp; 112 phòng chức năng.

Đối với kết quả công nhận đạt chuẩn xóa mù chữ, toàn huyện có 16/16 xã, thị trấn đạt chuẩn xóa mù chữ mức độ 2. Số người trong độ tuổi từ 15-25 được công nhận chuẩn biết chữ chiếm gần 97%. Số người từ 15-35 tuổi được công nhận chuẩn biết chữ chiếm hơn 95,1%. Số người từ 15-60 tuổi được công nhận chuẩn biết chữ trên 92,8 %. Huyện Bắc Yên đã thực hiện đầy đủ các văn bản chỉ đạo, quản lý và thực hiện đúng quy định về phổ cập giáo dục THCS - xóa mù chữ.

Đoàn công tác đã công nhận huyện Bắc Yên đạt chuẩn phổ cập giáo dục THCS mức độ 2, xóa mù chữ mức độ 2 tại thời điểm tháng 11 năm 2022. Đồng thời, đề nghị Ban chỉ đạo phổ cập giáo dục, xóa mù chữ của huyện tiếp tục đẩy mạnh chỉ đạo, quản lý, thực hiện phổ cấp giáo dục THCS - xóa mù chữ  trong những năm tới. Tiếp tục đầu tư cơ sở vật chất, thiết bị dạy học và nâng cao nghiệp vụ cho giáo viên.